AT1G61280.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.546 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase, GPI19/PIG-P subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase, GPI19/PIG-P subunit; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PIG-P (InterPro:IPR013717), Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase, GPI19/PIG-P subunit (InterPro:IPR016542); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase, GPI19/PIG-P subunit (TAIR:AT2G39445.1); Has 327 Blast hits to 327 proteins in 142 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 135; Fungi - 91; Plants - 56; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 45 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:22603586..22604081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15612.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 137 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLSLNQEVHG PKTSEVYGFV GSISIVVATV IFLIWGYVPD KFLESIGIYY YPSKYWAMAM PMYSMVTLLV ALVFYIGLNF MSTSKPTSLN TLFDDYSRED 101: VNFLPLMKNG EDRPIDPISD IDITRINDLM FDSHLAK |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)