AT1G60740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.800 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Thioredoxin superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Thioredoxin superfamily protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, antioxidant activity; INVOLVED IN: cell redox homeostasis; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: male gametophyte, cultured cell, pollen tube, leaf; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin-like (InterPro:IPR017936), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336), Redoxin (InterPro:IPR013740); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: thioredoxin-dependent peroxidase 2 (TAIR:AT1G65970.1); Has 4009 Blast hits to 4009 proteins in 876 species: Archae - 11; Bacteria - 1529; Metazoa - 175; Fungi - 308; Plants - 243; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1743 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:22361127..22361817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17473.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 162 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPITVGDVV PDGTISFFDE NDQLQTVSVH SIAAGKKVIL FGVPGAFTPT CSMSHVPGFI GKAEELKSKG IDEIICFSVN DPFVMKAWGK TYQENKHVKF 101: VADGSGEYTH LLGLELDLKD KGLGIRSRRF ALLLDNLKVT VANVENGGEF TVSSAEDILK AL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)