AT1G60660.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.993 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome B5-like protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
member of Cytochromes b5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
cytochrome B5-like protein (CB5LP); FUNCTIONS IN: heme binding; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b5, heme-binding site (InterPro:IPR018506), Cytochrome b5 (InterPro:IPR001199); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome B5 isoform A (TAIR:AT1G26340.1); Has 3645 Blast hits to 3620 proteins in 449 species: Archae - 2; Bacteria - 26; Metazoa - 975; Fungi - 1355; Plants - 764; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 523 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22342589..22342954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 13710.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 121 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIAVIGLLLG FLVSALFLIQ GKRRRTNDNQ EKKRSSSEPV EDVVRPKSYS KSEVAVHNKR NDCWIIIKDK VYDITSYVEE HPGGDAILDH AGDDSTDGFF 101: GPQHATRVFD MIEDFYIGEL H |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)