AT1G60530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Dynamin related protein 4A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Dynamin related protein 4A (DRP4A); FUNCTIONS IN: GTP binding, GTPase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dynamin, GTPase domain (InterPro:IPR001401), Interferon-induced Mx protein (InterPro:IPR015577); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dynamin related protein 4C (TAIR:AT1G60500.1); Has 2623 Blast hits to 2600 proteins in 285 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1028; Fungi - 818; Plants - 486; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 291 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:22299797..22301167 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32884.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 301 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGGSKMSNDY EIDVEAGMSS LSIVNTPIEA PIVSSYNDRI RPLLDTVDRL RNLNVMREGI QLPTIVVVGD QSSGKSSVLE SLAGINLPRG QGICTRVPLV 101: MRLQRSSSPE PEIWLEYSDK VVPTDEEHVA EAICAATDVI AGTGEGVSDT PLTLSVKKNN VPDLTMVDLP GITRVPVNGQ PENIYEQISR MIMKYIEPQE 201: SIILNVLSAT VDFTTCESIR MSRQVDKTGE RTLAVVTKAD MAPEGLLQKV TADDVSIGLG YICVRNRIGE ETYEEARVQE DLLFRTHPLL SLIDGDIVGI 301: L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)