AT1G60500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.967 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Dynamin related protein 4C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Dynamin related protein 4C (DRP4C); FUNCTIONS IN: GTP binding, GTPase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: egg cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dynamin GTPase effector (InterPro:IPR003130), Dynamin, GTPase domain (InterPro:IPR001401), GTPase effector domain, GED (InterPro:IPR020850), Dynamin central region (InterPro:IPR000375), Interferon-induced Mx protein (InterPro:IPR015577); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dynamin related protein 4A (TAIR:AT1G60530.1); Has 2653 Blast hits to 2628 proteins in 285 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1034; Fungi - 820; Plants - 506; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 293 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:22291582..22293822 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74601.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 669 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVKKKVATKK NSPSLAIAKK KSRSNKDVVS VEAPIISSYN DRIRPLLDTV DRLRNLNVMR EGIHLPTIVV VGDQSSGKSS VLESLAGISL PRGQGICTRV 101: PLVMRLQRSS SPEPEIWLEY NDKVVPTDEE HIAEAIRAAT DVIAGSGKGV SDAPLTLHVK KAGVPDLTMV DLPGITRVPV NGQPENIYEQ ISGMIMEYIE 201: PQESIILNVL SATVDFTTCE SIRMSRKVDK TGQRTLAVVT KADMAPEGLL QKVTADDVSI VLGYVCVRNR IGEETYEEAR MQEELLFRTH PVLSLIDEDI 301: VGIPVLAQKL MLIQSSMIAR CLPKIVSKIN QKLDTAVLEL NKLPMVMAST GEALMALMDI IGSAKESLLR ILVQGDFSEY PDDQNMHCTA RLADMLSQFS 401: DSLQAKPKEV AEFLMDEIKI LDECKCVGLP NFIPRSAFLA ILSQHVDGIQ DKPVEFINKI WDYIEDVLSS VTAKRSDNFP QIQSSIKRAG RNLISKIKEQ 501: SVNRVMEIVE MEKLTDYTCN PEYMTSWTQK TSAQESFIDA VVKNENIPDY FSVTGFGNVK ISHLRKYHAH LLIPAFDMKM RITSYWKIVL RRIVDNLALY 601: LQLSVKSLVN TRFQKEIVAE MVDPRDGGGV EKMLEESPLV ASKREKLQNS IKLLKESKDA VAAIVDQNC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)