AT1G60450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galactinol synthase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
galactinol synthase 7 (GolS7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galactinol synthase 4 (TAIR:AT1G60470.1); Has 1127 Blast hits to 1126 proteins in 260 species: Archae - 0; Bacteria - 80; Metazoa - 260; Fungi - 247; Plants - 417; Viruses - 63; Other Eukaryotes - 60 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22271226..22273214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37770.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 332 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTPETHVDMI NASEKAPKER AYVTFLAGNG DYVKGVVGLA KGLRKVKSAY PLVVAMLPDV PEEHREILRS QGCIVREIEP VHPPDSQDAY ARAYYIINYS 101: KLRIWNFEEY NKMIYLDADI QVFGNIDDLF DMQDGYLHGV LSCFCEKIWS YTPLYSIGYC QYCPEKVVWP AEMESAPPSP YFNAGMFVFE PNPLTYESLL 201: QTLQVTPPTP FAEQDFLNMF FGKVFKPVSP VYNLILSVLW RHPGKVDLES VKVVHYCPPG SKPWRYTGEE PNMDREDVKM LIKKWWDIYN DESLDFKPKS 301: PADLEATVLE STIIASVTEA PLSYSPAAPS AA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)