AT1G58300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.986 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heme oxygenase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member (HO4) of the heme oxygenase family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
heme oxygenase 4 (HO4); FUNCTIONS IN: heme oxygenase (decyclizing) activity, oxidoreductase activity, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, heme oxidation; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 7 plant structures; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem oxygenase-like, multi-helical (InterPro:IPR016084), Haem oxygenase-like (InterPro:IPR016053), Haem oxygenase (decyclizing), plant (InterPro:IPR016951); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: heme oxygenase 3 (TAIR:AT1G69720.1); Has 273 Blast hits to 273 proteins in 64 species: Archae - 0; Bacteria - 70; Metazoa - 13; Fungi - 0; Plants - 126; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 64 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:21628015..21629996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32954.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 283 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSRLNASC RFPASRRLDC ESYVSLRAKT VTIRYVRTIA APRRHLVRRA NEDQTLVVNV VAAAGEKPER RYPREPNGFV EEMRFVVMKI HPRDQVKEGK 101: SDSNDLVSTW NFTIEGYLKF LVDSKLVFET LERIINESAI QAYAGLKNTG LERAENLSRD LEWFKEQGYE IPESMVPGKA YSQYLKNIAE KDPPAFICHF 201: YNINFAHSAG GRMIGTKVAE KILDNKELEF YKWDGQLSEL LQNVSEELNK VAELWTREEK NHCLEETEKS FKFYWEIFRY LLS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)