AT1G58180.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta carbonic anhydrase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
beta carbonic anhydrase 6 (BCA6); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: carbon utilization; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, prokaryotic-like, conserved site (InterPro:IPR015892), Carbonic anhydrase (InterPro:IPR001765); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta carbonic anhydrase 5 (TAIR:AT4G33580.1); Has 5080 Blast hits to 5063 proteins in 1507 species: Archae - 55; Bacteria - 3884; Metazoa - 56; Fungi - 211; Plants - 357; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 517 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:21538010..21539711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33073.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 290 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFTLGGRAR RLVSATSVHQ NGCLHKLQQI GSDRFQLGEA KAIRLLPRRT NMVQELGIRE EFMDLNRETE TSYDFLDEMR HRFLKFKRQK YLPEIEKFKA 101: LAIAQSPKVM VIGCADSRVC PSYVLGFQPG EAFTIRNVAN LVTPVQNGPT ETNSALEFAV TTLQVENIIV MGHSNCGGIA ALMSHQNHQG QHSSLVERWV 201: MNGKAAKLRT QLASSHLSFD EQCRNCEKES IKDSVMNLIT YSWIRDRVKR GEVKIHGCYY NLSDCSLEKW RLSSDKTNYG FYISDREIWS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)