AT1G55805.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BolA-like family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
BolA-like family protein; FUNCTIONS IN: transcription regulator activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: BolA-like protein (InterPro:IPR002634); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: chloroplast sulfur E (TAIR:AT4G26500.1); Has 3687 Blast hits to 3687 proteins in 1115 species: Archae - 26; Bacteria - 2113; Metazoa - 172; Fungi - 142; Plants - 137; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1097 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:20858956..20859438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17673.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 160 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFSSSIRLIV SGFHRTQPLK SPVNSPSVFI SVPKFFNSES KSTGTGSRSV AMSSVEKTGS DSGAIENRAS RMREKLQKEL EPVELVIEDV SYQHAGHAGM 101: KGRTDDETHF NVKIVSKGFE GMNLVKRHRL VYHLLREELD TGLHALSIVS KTPSESPSKD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)