AT1G55190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PRA1 (Prenylated rab acceptor) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
PRA7; INVOLVED IN: vesicle-mediated transport; LOCATED IN: endoplasmic reticulum, plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prenylated rab acceptor PRA1 (InterPro:IPR004895); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PRA1 (Prenylated rab acceptor) family protein (TAIR:AT3G13720.1); Has 523 Blast hits to 523 proteins in 128 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 75; Fungi - 90; Plants - 309; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 43 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:20588450..20589019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21072.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 189 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTNYGAIPTS SHPSPAIDLE YISRAKHRIK SGLATRRPWK SMFDFESMTL PHGFFDAISR IKTNLGYFRA NYAIGVLFIL FLSLLYHPTS LIVLSILVVF 101: WIFLYFLRDE PLVVFGYQID DRTVLIGLSV LTVVMLLLTH ATSNILGSLL TAAVLVLIHA AVRRSDNLFL DEEAAAVTEA SGLMSYPSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)