AT1G54000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein; FUNCTIONS IN: lipase activity, hydrolase activity, acting on ester bonds, carboxylesterase activity; INVOLVED IN: lipid metabolic process; LOCATED IN: vacuolar membrane, plasma membrane, vacuole, plant-type cell wall, plant-type vacuole; EXPRESSED IN: stem, cultured cell, callus; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, GDSL (InterPro:IPR001087); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein (TAIR:AT1G54010.1); Has 3190 Blast hits to 3160 proteins in 155 species: Archae - 0; Bacteria - 224; Metazoa - 0; Fungi - 4; Plants - 2945; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:20154548..20156365 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43196.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMANNCNLVS VLCVILVLTL FHNPITVAGQ NSPVVALFTF GDSNFDAGNK QTLTKTLVAQ GFWPYGKSRD DPNGKFSDGL ITPDFLAKFM KIPLAIAPAL 101: QPNVNVSRGA SFAVEGATLL GAPVESMTLN QQVKKFNQMK AANWNDDFVA KSVFMIYIGA NDYLNFTKNN PTADASAQQA FVTSVTNKLK NDISALYSSG 201: ASKFVIQTLA PLGCLPIVRQ EYNTGMDQCY EKLNDLAKQH NEKIGPMLNE MARNSPASAP FQFTVFDFYN AVLTRTQRNQ NFRFFVTNAS CCGVGSHDAY 301: GCGLPNVHSK LCEYQRSFLF FDGRHNSEKA QEMFAHLLFG ADTNVVQPMN VRELTVYPVD EPMREFWVPP TPATVHASDS SSSTSRGYEY Y |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)