AT1G52940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.887 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 5 (PAP5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Purple acid phosphatase, N-terminal (InterPro:IPR015914), Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Purple acid phosphatase-like, N-terminal (InterPro:IPR008963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 11 (TAIR:AT2G18130.1); Has 1805 Blast hits to 1772 proteins in 366 species: Archae - 3; Bacteria - 516; Metazoa - 182; Fungi - 94; Plants - 756; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 254 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:19716402..19723716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45422.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 396 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLETFPPPA GYNAPEQVHI TQGDHNGRGM IISWVTSLNE DGSNVVTYWI ASSDGSDNKS VIATTSSYRY FDYTSGYLHH AIIKELEYKT KYFYELGTGR 101: STRQFNLTPP KVGPDVPYTF GVIGDLGQTY ASNQTLYNYM SNPKGQAVLF AGDLSYADDH PNHDQSKWDS YGRFVEPSAA YQPWIWAAGN HEIDYAQSIG 201: ETQPFKPYKN RYHVPYRASQ NKYTPQNSWL QDEFKKVNRS ETPWLIVLVH APWYNSNNYH YMEGESMRVT FEPWFVENKV DIVFAGHVHA YERSERVSNI 301: QYNITDGMST PVKDQNAPVY ITIGDGGNIE GIANIFTDPQ PSYSAFREAS FGHALLEIKN RTHAHYTWHR NKEDEAVIAD SIWLKNRYYL PEEETI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)