AT1G51780.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.607 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : IAA-leucine resistant (ILR)-like gene 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a member of the six Arabidopsis IAA-amino acid conjugate hydrolase subfamily and conjugates and is very similar to IAR3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
IAA-leucine resistant (ILR)-like gene 5 (ILL5); FUNCTIONS IN: metallopeptidase activity, IAA-amino acid conjugate hydrolase activity; INVOLVED IN: proteolysis, regulation of systemic acquired resistance; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M20 (InterPro:IPR002933), Peptidase M20, dimerisation (InterPro:IPR011650), Peptidase M20D, amidohydrolase (InterPro:IPR010168), Peptidase M20D, mername-AA028/carboxypeptidase Ss1 (InterPro:IPR017439); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: peptidase M20/M25/M40 family protein (TAIR:AT1G51760.1); Has 13227 Blast hits to 13219 proteins in 2009 species: Archae - 135; Bacteria - 9794; Metazoa - 77; Fungi - 235; Plants - 313; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2673 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:19204602..19206453 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47384.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 435 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSFCKLVSFV LILHLLNSCL ISCSSNDLSQ IPKNFLSLAK REDFFDWMVG IRRRIHENPE LGYEEVETSK LVKTELDKMG VSYKNPVAVT GVIGYVGTGH 101: APFVALRADM DALPIQEMVE WEHKSKIPGK MHACGHDAHT TMLLGAAKLL KEHQEELQGT VILVFQPAEE GGAGAKKIVE AGVLENVGAI FGLHVSNLLG 201: LGQLSSREGL LMAGSGRFKA TISGKGGHAA LPQFAIDPVL AASNVILSLQ HLVSREADPL DSQVVTVATF EGSDAFNVIP DSVTIGGTFR ALLPKSFEQL 301: KQRIVQVITT QASVNMCNAT VDFLEDETPP FPPTVNNKTL HLFYKNVSVD MLGIENYVET LPVMVSEDFA FYQQAIPGHF SFVGMQNKSH SPMANPHSPF 401: FEVNEELLPY GASLLASLAT RYLLDSSSSP NKDEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)