AT1G51730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ubiquitin-conjugating enzyme family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ubiquitin-conjugating enzyme family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like (InterPro:IPR016135), RWD (InterPro:IPR006575); Has 930 Blast hits to 928 proteins in 205 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 543; Fungi - 220; Plants - 66; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 99 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19186812..19188638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28707.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 3.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 252 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTEYKQEQEM EIEALEAILM DEFKEIHSSE SGLNTSNRCF QITVTPQDDE LEELAIPPVQ LALVFSHTEN YPDEAPLLDV KSIRGIHVSD LTILKEKLEQ 101: EASENLGMAM IYTLVSSAKD WLSEHYGQDD AAEFAEVEAA KEDEVIVPHG EPVTLETFLA WRERYEAELA LERAKLMPES ALTAPKEKKL TGRQWFESGR 201: GRGTVVIADE EDEEEDEEDI DFEDEDFEDD EEDMLEHYLA EKSDSSAPPT RT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)