AT1G50510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : indigoidine synthase A family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
indigoidine synthase A family protein; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: peroxisome, plasma membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Indigoidine synthase A like protein (InterPro:IPR007342); Has 1680 Blast hits to 1674 proteins in 598 species: Archae - 0; Bacteria - 980; Metazoa - 68; Fungi - 108; Plants - 51; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 473 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:18716578..18719060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34801.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 330 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSLAQSRI SNLQNHLSPL EANNKLRSLV KISPQVSEAL SNGRAVVALE STIISHGMPY PQNLQTAKEV ESIVRENGAI PATIAILNGV PCIGLSEEEL 101: ERLASLGKSV QKTAGRDIAN VVATRGNGAT TVSATLFFAS MVGIQVFVTG GIGGVHRHAN HSMDISSDLT ALGRTPIAVI SAGVKSILDI PKTLEYLETQ 201: EVYVAAYKSD EFPAFFTEKS GCKAPSRVNS PEDCARVIDA NMKLNRQAGI LFAIPIPKHH SAAGNLIESA TQRALTEARE QNVTGNAETP FLLARVNELT 301: GGTSLAANIA LVKNNALIGS QIAVALSQLM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)