AT1G47840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.524 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : hexokinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative hexokinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
hexokinase 3 (HXK3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hexokinase, N-terminal (InterPro:IPR022672), Hexokinase, conserved site (InterPro:IPR019807), Hexokinase, C-terminal (InterPro:IPR022673), Hexokinase (InterPro:IPR001312); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: hexokinase 1 (TAIR:AT4G29130.1); Has 2416 Blast hits to 2143 proteins in 322 species: Archae - 0; Bacteria - 89; Metazoa - 1294; Fungi - 612; Plants - 287; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 134 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:17616243..17618859 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53883.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 493 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLMFSSPVV TPALGSFTFS SRPRSNYIVM SAVRSNSAST CPILTKFQKD CATPTPYLRN VANAIADDMR DGLAVEGGGD LEMILTFVDA LPSGNEEGLF 101: YALDLGGTNF RVRSVQLGGK KERVLATESE QISISQKLMI GTSEELFGFI ASKLANFVAK EKPGRFLLEE GRKRELGFTF SFPVKQTSID SGTLSKWTKG 201: FKVSGMEGKN VVACLNEAME AHGLDMRVSA LVNDGVGTLA GARYWDEDVM VGVILGTGTN ACYVEQKHAI PKLRSKSSSG TTIINTEWGG FSKILPQTIF 301: DLEMDETSLN PGEHLYEKMI SGMYLGEIVR RVLLHMCETS DLFGHFAPAK LSTPLALRTE HLCKMQEDNT DDLRDVGSIL YDFLDVEANM NARRRVVEVC 401: DTVVKRGGRL AGAGIVAILE KIEKDTKRMG SGKRTVVAMD GALYEKYPQY RQYMQDALVE LLGHKLASHV AIKHTKDVSG LGAALLAATN SIY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)