AT1G47600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta glucosidase 34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a myrosinase. Over-expression led to a glucosinolate profile change. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
beta glucosidase 34 (BGLU34); FUNCTIONS IN: thioglucosidase activity, beta-glucosidase activity, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds; INVOLVED IN: glucosinolate metabolic process, response to salt stress; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, family 1, active site (InterPro:IPR018120), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta glucosidase 35 (TAIR:AT1G51470.1); Has 11204 Blast hits to 10858 proteins in 1466 species: Archae - 142; Bacteria - 7723; Metazoa - 713; Fungi - 195; Plants - 1441; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 990 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:17491771..17494589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57545.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 511 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIPKAHYSL AVLVLLFVVV SSSQKVCNPE CKAKEPFHCD NTHAFNRTGF PRNFTFGAAT SAYQIEGAAH RALNGWDYFT HRYPEKVPDR SSGDLACDSY 101: DLYKDDVKLL KRMNVQAYRL SIAWSRVLPK GRLTGGVDEN GITYYNNLIN ELKANGIEPY VTIFHWDVPQ TLEDEYGGFL STRIVEDYTN YAELLFQRFG 201: DRVKFWITLN QPFSLATKGY GDGSYPPGRC TGCELGGDSG VEPYTVAHNQ LLAHAKTVSL YRKRYQKFQG GKIGTTLIGR WFAPLNEFSE LDKAAAKRAF 301: DFFVGWFLDP LVYGKYPTIM REMVGDRLPE FTPEQSALVK GSLDFLGLNY YVTQYATDAP PPTQLNAITD ARVTLGFYRN GVPIGVVAPS FVYYPPGFRQ 401: ILNYIKDNYK NPLTYITENG VADLDLGNVT LATALADNGR IQNHCSHLSC LKCAMKDGCN VAGYFAWSLM DNYEFGNGYT LRFGMNWVNF TNPADRKEKA 501: SGKWFSKFLA K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)