AT1G47220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cyclin A3;3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cyclin A3;3 (CYCA3;3); FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase regulator activity; INVOLVED IN: regulation of cell cycle; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: pollen tube; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin (InterPro:IPR006670), G2/mitotic-specific cyclin A (InterPro:IPR015453), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin, A/B/D/E (InterPro:IPR014400); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclin-dependent protein kinase 3;2 (TAIR:AT1G47210.2); Has 4353 Blast hits to 4345 proteins in 371 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1994; Fungi - 550; Plants - 1105; Viruses - 31; Other Eukaryotes - 673 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:17303676..17305197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38131.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 327 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSKKDKQIH SDHNPQDASP VEWAEIRHKL LAFQENIQSG SDIDARSDDP QMCGLYVSDI YEYLRELEVK PKLRPLHDYI EKIQEDITPS KRGVLVDWLV 101: EVAEEFELVS ETLYLTVSYI DRFLSLKMVN EHWLQLVGVS AMFIASKYEE KRRPKVEDFC YITANTYTKQ DVLKMEEDIL LALEFELGRP TTNTFLRRFI 201: RVAQEDFKVP NLQLEPLCCY LSELSMLDYS CVKFVPSLLA ASAVFLARFI ILPNQHPWSQ MLEECTKYKA ADLQVCVEIM LDLYLSRSEG ASKAVREKYK 301: QHKFQYVAAI PVYQELPVTF WEDVVTI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)