AT1G47210.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.971 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cyclin-dependent protein kinase 3;2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cyclin-dependent protein kinase 3;2 (CYCA3;2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin (InterPro:IPR006670), G2/mitotic-specific cyclin A (InterPro:IPR015453), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin, A/B/D/E (InterPro:IPR014400); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CYCLIN A3;4 (TAIR:AT1G47230.1); Has 4323 Blast hits to 4316 proteins in 367 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1987; Fungi - 532; Plants - 1111; Viruses - 34; Other Eukaryotes - 659 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:17301036..17302584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42463.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 372 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTEQEICVRV TRAAAKRKAS TAMGIDGDRV NKKRVVLGEL LNVSNVNLLA NLNQKKETQK PKRNLKPPPA KQIKSAPVAI IDLESKSDID SRSDDPQMCG 101: PYVADIYEYL RQLEVKPKQR PLPDYIEKVQ KDVTPSMRGV LVDWLVEVAE EYKLGSETLY LTVSHIDRFL SLKTVNKQKL QLVGVSAMLI ASKYEEISPP 201: KVDDFCYITD NTFSKQDVVK MEADILLALQ FELGRPTINT FMRRFTRVAQ DDFKVPHLQL EPLCCYLSEL SILDYKTVKF VPSLLAASAV FLARFIIRPK 301: QHPWNQMLEE YTKYKAADLQ VCVGIIHDLY LSRRGGALQA VREKYKHHKF QCVATMPVSP ELPVTFWEDV TI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)