AT1G45231.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity; INVOLVED IN: RNA capping, RNA methylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202), RNA cap guanine-N2 methyltransferase (InterPro:IPR019012); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT1G30550.2); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:17148019..17151194 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60406.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 538 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKVRGEVEE AEGEAIEALG SLFKLTQIHL WVDTDTPLFH QHSGNKSVDD TYGIANNGLM KEMNDLGLPV SFRTNKQWKN RTRGYQKKGF KDRLDEEVNV 101: ILKVEDTLNL VSALNEEVES PCFEEDCVQV IEVEEENHEV VVGSCFLGNG DGDSVLASET IDSHDSSVWK VYWDSFYGRS YFYNFKTQES KWEPPLGMEH 201: LAYSDESHNL SELVIEKHHD DLSGTVLGDD VPFDKADDLG GVCQSQLEAE ATEEVNSLID TYQETSIGNQ SLDITSLGEE GTGAYVVSSV RKAKKESRRS 301: RAKKKLLNSY TGTEMKGVPE EYSPILGKYW CQRYLLFSRF DEGIKMDEEG WFSVTPELIA KHHATRCNEG IVIDCFTGVG GNAIQFASRS HYVIAIDLDP 401: KKLDLAKHNA AIYGVADKID FVKGDFFDLA HNLKAGTVFL SPPWGGPDYL KASTYDMKTM LRPRDGDALF KAAMNIASTI IMFLPRNVDI NQLAELALST 501: SPPWSLEVEK NYLNGKLKAV TAYYVRQDDC KKLKRRPQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)