AT1G44350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.500 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : IAA-leucine resistant (ILR)-like gene 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein similar to IAA amino acid conjugate hydrolase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
IAA-leucine resistant (ILR)-like gene 6 (ILL6); FUNCTIONS IN: metallopeptidase activity, IAA-amino acid conjugate hydrolase activity; INVOLVED IN: proteolysis, regulation of systemic acquired resistance, auxin metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M20 (InterPro:IPR002933), Peptidase M20D, amidohydrolase (InterPro:IPR010168), Peptidase M20D, mername-AA028/carboxypeptidase Ss1 (InterPro:IPR017439), Peptidase M20, dimerisation (InterPro:IPR011650); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: peptidase M20/M25/M40 family protein (TAIR:AT1G51760.1); Has 12322 Blast hits to 12314 proteins in 1908 species: Archae - 129; Bacteria - 9070; Metazoa - 89; Fungi - 234; Plants - 310; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2490 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:16834749..16838201 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50823.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 464 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDNLRKLNLL SVSLTIIFVS LTIATNLPFF EVKYPNNNPF GMLLRPTPIK NQSLGLPAHV GSDECRVWTK ACSDEILRLT YQPDNVAWLK RVRRTIHENP 101: ELAFEEYETS RLIRSELDRM GIMYRYPLAK TGIRAWIGSG GPPFVAVRAD MDALPIQEAV EWEHISKVAG KMHACGHDAH VTMLLGAAHI LKAREHLLKG 201: TVVLLFQPAE EAGNGAKNMI EDGALDDVEA IFAVHVSHIH PTGVIGSRSG PLLAGCGIFR AVITSEDSRG AANLLLAASS AVISLQGIVS REASPLDSQV 301: VSVTSFDGGH SLDVAPDTVV LGGTFRAFSN SSFYYLKKRI QEVLMDQVGV FGCQATVNFF EKQNAIYPPT TNNDATYNHL KKVTIDLLGD SHFTLAPQMM 401: GAEDFAFYSE IIPAAFYFIG IRNEELGSVH IAHSPHFMID EDSLPVGAAV HAAVAERYLN DKHS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)