AT1G44318.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Aldolase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
hemb2; FUNCTIONS IN: porphobilinogen synthase activity, catalytic activity, metal ion binding; INVOLVED IN: porphyrin biosynthetic process; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Tetrapyrrole biosynthesis, porphobilinogen synthase (InterPro:IPR001731); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Aldolase superfamily protein (TAIR:AT1G69740.2); Has 6838 Blast hits to 6838 proteins in 2133 species: Archae - 162; Bacteria - 3759; Metazoa - 160; Fungi - 160; Plants - 79; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2518 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:16831016..16833916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44880.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 406 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSSMFRSPC KIPSVKGFEQ KSYVGLKAAS YNVRVNSFKS SEVASQLQKI DSTLIWPVNA LEAPPVPSKP ATPLIDQPLQ LSRRARRNRK CPTQRAAFQE 101: TNISPANFIY PLFIHEGEVD IPITSMPGRY MLGWRHGLIE EVARALDVGV NSVKLYPKVP EALKSPTGEE AFNDNGLIPR TVRLLKDRFP DLVIYTDVNF 201: DEYSTTGHGG IVGEDGVILN DETIHQLRKQ AVSQARAGAD VVCTSEMLDG RVGAVRAALD AEGFQDVSIM SYSVKYTSSL YGRFRKVQLD KKTYQINPAN 301: SREALLEARE DEAEGADILM VKPALPSLDI IRLLKNQTLL PIGACQVSGE YSMIKAAGLL KMIDEEKVMM ESLLCIRRAG ADLILTYFAL QAATKLCGEN 401: KRFSSN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)