AT1G44170.3
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : aldehyde dehydrogenase 3H1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein similar to the aldehyde dehydrogenase cp-ADH from C.plantagineum. Constitutively expressed at low levels. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aldehyde dehydrogenase 3H1 (ALDH3H1); FUNCTIONS IN: 3-chloroallyl aldehyde dehydrogenase activity, aldehyde dehydrogenase (NAD) activity; INVOLVED IN: response to desiccation, response to salt stress, response to abscisic acid stimulus; LOCATED IN: endoplasmic reticulum, plastid, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldehyde/histidinol dehydrogenase (InterPro:IPR016161), Aldehyde dehydrogenase (InterPro:IPR015590), Aldehyde dehydrogenase, N-terminal (InterPro:IPR016162), Aldehyde dehydrogenase NAD(P)-dependent (InterPro:IPR012394), Aldehyde dehydrogenase, conserved site (InterPro:IPR016160); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aldehyde dehydrogenase 3I1 (TAIR:AT4G34240.1); Has 53834 Blast hits to 53786 proteins in 2931 species: Archae - 469; Bacteria - 32921; Metazoa - 2418; Fungi - 2071; Plants - 990; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14965 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:16796564..16798574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46217.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 421 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFYQQRVLVS LLRNSIKLAL KQLKNWMAPE KAKTSLTTFP ASAEIVSEPL GVVLVISAWN YPFLLSIDPV IGAISAGNAV VLKPSELAPA SSALLTKLLE 101: QYLDPSAVRV VEGAVTETSA LLEQKWDKIF YTGSSKIGRV IMAAAAKHLT PVVLELGGKS PVVVDSDTDL KVTVRRIIVG KWGCNNGQAC VSPDYILTTK 201: EYAPKLIDAM KLELEKFYGK NPIESKDMSR IVNSNHFDRL SKLLDEKEVS DKIVYGGEKD RENLKIAPTI LLDVPLDSLI MSEEIFGPLL PILTLNNLEE 301: SFDVIRSRPK PLAAYLFTHN KKLKERFAAT VSAGGIVVND IAVHLALHTL PFGGVGESGM GAYHGKFSFD AFSHKKAVLY RSLFGDSAVR YPPYSRGKLR 401: LLKALVDSNI FDLFKVLLGL A |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)