AT1G36340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.989 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ubiquitin-conjugating enzyme 31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ubiquitin-conjugating enzyme 31 (UBC31); FUNCTIONS IN: ubiquitin-protein ligase activity, small conjugating protein ligase activity; INVOLVED IN: regulation of protein metabolic process, post-translational protein modification; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: pedicel; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like (InterPro:IPR016135), Ubiquitin-conjugating enzyme, E2 (InterPro:IPR000608); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ubiquitin-conjugating enzyme 11 (TAIR:AT3G08690.2); Has 10356 Blast hits to 10339 proteins in 396 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 4631; Fungi - 2141; Plants - 1907; Viruses - 26; Other Eukaryotes - 1647 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:13683791..13684924 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17833.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 154 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFKKMDKKAA QRIAMEYRAM ISKESLFSIG QNSNNIYEWT AVIRGPDGTP YEGGMFNLSI KFPTDYPFKP PKFTFKTPIY HPNINDEGSI CMNILKDKWT 101: PALMVEKVLL SILLLLEKPN PDDPLVPEIG QLFKNNRFQF DQRAREFTAR HANN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)