AT1G36180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acetyl-CoA carboxylase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
acetyl-CoA carboxylase 2 (ACC2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
acetyl-CoA carboxylase 2 (ACC2); FUNCTIONS IN: acetyl-CoA carboxylase activity; INVOLVED IN: metabolic process, fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 14 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acetyl-coenzyme A carboxyltransferase, N-terminal (InterPro:IPR011762), Carboxyl transferase (InterPro:IPR000022), Biotin/lipoyl attachment (InterPro:IPR000089), Carbamoyl phosphate synthase, large subunit, N-terminal (InterPro:IPR005481), PreATP-grasp-like fold (InterPro:IPR016185), ATP-grasp fold (InterPro:IPR011761), Biotin carboxylase, C-terminal (InterPro:IPR005482), Single hybrid motif (InterPro:IPR011053), Carbamoyl phosphate synthetase, large subunit, ATP-binding (InterPro:IPR005479), Acetyl-CoA carboxylase, central region (InterPro:IPR013537), Biotin-binding site (InterPro:IPR001882), Biotin carboxylation domain (InterPro:IPR011764), ATP-grasp fold, subdomain 2 (InterPro:IPR013816), Acetyl-coenzyme A carboxyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR011763), Rudiment single hybrid motif (InterPro:IPR011054), Pre-ATP-grasp fold (InterPro:IPR013817); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: acetyl-CoA carboxylase 1 (TAIR:AT1G36160.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:13546047..13558339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 262744.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 2355 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MEMRALGSSC STGNGGSAPI TLTNISPWIT TVFPSTVKLR SSLRTFKGVS SRVRTFKGVS STRVLSRTKQ QFPLFCFLNP DPISFLENDV SEAERTVVLP 0101: DGSVNGAGSV NGYHSDVVPG RNVAEVNEFC KALGGKRPIH SILVATNGMA AVKFIRSVRT WAYETFGSEK AVKLVAMATP EDMRINAEHI RIADQFVEVP 0201: GGTNNNNYAN VQLIVEMAEV TRVDAVWPGW GHASENPELP DALKEKGIIF LGPPADSMIA LGDKIGSSLI AQAADVPTLP WSGSHVKIPP GRSLVTVPEE 0301: IYKKACVYTT EEAIASCQVV GYPAMIKASW GGGGKGIRKV HNDDEVRALF KQVQGEVPGS PIFIMKVASQ SRHLEAQLLC DQYGNVAALH SRDCSVQRRH 0401: QKIIEEGPIT VAPQETIKKL EQAARRLAKS VNYVGAATVE YLYSMDTGEY YFLELNPRLQ VEHPVTEWIA EVNLPAAQVA VGMGIPLWQI PEIRRFYGME 0501: HGGGYDSWRK TSVVASPFDF DEAESLRPKG HCVAVRVTSE DPDDGFKPTS GEIQELSFKS KPNMWSYFSV KSGGGIHEFS DSQFGHVFAF GESRSVAIAN 0601: MVLALKEIQI RGDIRTNVDY TIDLLHASDY RENKIHTGWL DSRIAMRVRA ERPPWYLSVV GGALYKASTT SSAVVSDYVG YLEKGQIPPK HISLVHSQVS 0701: LNIEGSKYTI DVVRGGSGTY RLRMSNSEVV AEIHTLRDGG LLMQLDGKSH VIYAKEEATG TRLLIDGRTC LLQNDHDPSK LMAETPCKLL RYLVSDNSSI 0801: DTDTPYAEVE VMKMCMPLIS PASGVIHFKL SEGQAMQAGE LIAKLDLDDP SAVRKAKPFR GSFPRLGLPT AISGKVHQRC AATLNAARMI LAGYDHKVDE 0901: VLQDLLNCLD SPELPFLQWQ ECFAVLATRL PKDLRNMLEL KYKEFEIISK TSLTPDFPAK LLKGILEAHL SSCDEKERGS LERLIEPLMS LVKSYEGGRE 1001: SHARLIVHSL FEEYLSVEEL FNDNMLADVI ERMRQQYKKD RLKIVDIVLS HQGIIHKNKL VLRLMEQLVY PNPAAYREKL IRFSALNHTN YSQLALKASQ 1101: LLEQTKRSEL RSNIARSLSE LEMFTEAGEN MDTPKRKSAI SETMENLVSS SLAVEDALVG LFDHSDHTLQ RRVVETYIHR LYQPYVVKES VRMQWHQSGV 1201: IASWEFLEHF ERKNTGPDDH EISEKGIVAK SSKRKRGTMV IIKSLQFLPS IINASLRETN HSHCEYARAP LSGNMMHIAV VGINNQMSLL QDSGDEDQTQ 1301: ERVNKLAKIL KEEEVSLTLC SAGVGVISCI IQRDEGRTPM RHSFHWLMEK QYYVEEPLLR HVEPPLSVYL ELDKLKGYSN IQYSPSRDRQ WHMYSVTDRP 1401: VPIKRMFLRS LVRQTTMNDG FLLQQGQDYQ LSQTVLSMAF TSKCILRSLM NAMEELELNA HNAAMKPDHA HMFLCILREQ QIDDLVPYPR RFEVNAEDEE 1501: TTVETILEEA TQEIHRSVGV RMHALGVCEW EVRLWLVSSG LANGAWRVVV ANVTGRTCTV HIYREVEATG RNSLIYHSIT KKGPLHGTLI NGQYKPLNNL 1601: DRKRLAARRS NTTYCYDFPL AFETALELNW ASQHSGVRKP CKNRLINVKE LVFSNTEGSL GTSLIPVERP AGLNDIGMVA WILEMSTPEF PMGRKLLIVA 1701: NDVTFKAGSF GPREDAFFLA VTELACTKKL PLIYLAANSG ARLGVAEEVK ACFKVGWSDE VSPGNDFQYI YLSSEDYARI GSSVIAHEVK LPSGETRWVI 1801: DTIVGKEDGL GVENLTGSGA IAGAYSRAYN ETFTLTFVSG RSVGIGAYLA RLGMRCIQRL DQPIILTGFS TLNKLLGREV YSSHMQLGGP KIMGTNGVVH 1901: LTVSDDLEGV SAILNWLSYI PAYVGGPLPV LAPLDPPERT VEYIPENSCD PRAAIAGIND NTGKWLGGIF DKNSFVETLE GWARTVVTGR AKLGGIPIGV 2001: VAVETQTVMH VIPADPGQLD SHERVVPQAG QVWFPDSAAK TAQALMDFNR EQLPLFIIAN WRGFSGGQRD LFEGILQAGS AIVENLRTYR QPVFVYIPMM 2101: GELRGGAWVV VDSQINSDYI EMYADETARG NVLEPEGMIE IKFRRKELLE CMGRLDQTLI NLKANIQDAK RNKAYANIEL LQKQIKTREK QLLPVYTQIA 2201: TKFAELHDTS MRMAAKGVIK SVVEWSGSRS FFYKKLYRRI AESSLVRNIR KASGDILSYK SAMGLIQDWF RKSEIAKGKE EAWTDDQLFF TWKDNVSNYE 2301: QKLSELRTQK LLNQLAEIGN SSDLQALPQG LANLLNKVDL SRREELVDAI RKVLG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)