AT1G34760.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.955 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : general regulatory factor 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a 14-3-3 protein. Binds H+-ATPase in response to blue light. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
general regulatory factor 11 (GRF11); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 14-3-3 protein (InterPro:IPR000308); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: general regulatory factor 12 (TAIR:AT1G26480.1); Has 2697 Blast hits to 2689 proteins in 382 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1262; Fungi - 298; Plants - 762; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 375 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:12743981..12745603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28782.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 252 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENERAKQVY LAKLNEQAER YDEMVEAMKK VAALDVELTI EERNLLSVGY KNVIGARRAS WRILSSIEQK EESKGNEQNA KRIKDYRTKV EEELSKICYD 101: ILAVIDKHLV PFATSGESTV FYYKMKGDYF RYLAEFKSGA DREEAADLSL KAYEAATSSA STELSTTHPI RLGLALNFSV FYYEILNSPE RACHLAKRAF 201: DEAIAELDSL NEDSYKDSTL IMQLLRDNLT LWTSDLEEGG EQSKGHNQQD EN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)