AT1G33850.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S19 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S19 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: cytosolic small ribosomal subunit, ribosome; EXPRESSED IN: synergid; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S15, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005713), Ribosomal protein S19/S15 (InterPro:IPR002222); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S19 family protein (TAIR:AT5G09500.1); Has 756 Blast hits to 756 proteins in 292 species: Archae - 59; Bacteria - 0; Metazoa - 255; Fungi - 145; Plants - 198; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 99 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:12287913..12288210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 8139.25 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 70 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MEPEVVAAGI VKKRIFKKFS FRGVDLDALL DMSTEDLVKH FSSRIRRRFS RGFTRKPMAL IKKLRKAVKS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)