AT1G32380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) synthase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a P-dependent phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) synthase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) synthase 2 (PRS2); FUNCTIONS IN: magnesium ion binding, ribose phosphate diphosphokinase activity; INVOLVED IN: cellular biosynthetic process, nucleotide biosynthetic process, nucleoside metabolic process, ribonucleoside monophosphate biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribosyltransferase (InterPro:IPR000836), Phosphoribosyl pyrophosphokinase (InterPro:IPR005946), Phosphoribosyl pyrophosphate synthetase, conserved site (InterPro:IPR000842); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoribosyltransferase family protein (TAIR:AT2G35390.2); Has 11410 Blast hits to 11162 proteins in 2771 species: Archae - 272; Bacteria - 6075; Metazoa - 636; Fungi - 714; Plants - 210; Viruses - 13; Other Eukaryotes - 3490 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11682033..11684229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43335.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 400 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLALTSPP SVKIPSYLSS SSSSLFSRSS ISFRTTESRS RICVSGYAKC NLPKALNGNA RVPIINETTI PKFFDSSRLE KSVSRNNTKL KLFSGTANPA 101: LSQEIAWYMG LELGKVSIKR FADGEIYVQL KESVRGCDVF LVQPTCTPTN ENLMELLIMV DACRRASAKK VTAVIPYFGY ARADRKTQGR ESIAAKLVAN 201: LITEAGADRV LACDLHSGQS MGYFDIPVDH VYCQPVILDY LASKSISSED LVVVSPDVGG VARARAFAKK LSDAPLAIVD KRRHGHNVAE VMNLIGDVKG 301: KVAVMVDDII DTAGTIVKGA ALLHEEGARE VYACCTHAVF SPPAIERLSS GLLQEVIVTN TLPVAEKNYF PQLTILSVAN LLGETIWRVH DDSSVSSIFL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)