AT1G30825.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Arp2/3 complex, 34 kD subunit p34-Arc | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Involved in trichome maturation. mutant displays enlarged trichomes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DISTORTED TRICHOMES 2 (DIS2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Arp2/3 complex, 34kDa subunit p34-Arc (InterPro:IPR007188); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: actin-related protein C2B (TAIR:AT2G33385.2); Has 407 Blast hits to 407 proteins in 172 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 148; Fungi - 133; Plants - 82; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 44 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:10961106..10962999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36042.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 318 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MILLQSHSRF LLQTLLTRAQ NLDKAVELDY QWIEFDDVRY HVQVTMKNPN LLLLSVSLPN PPPEAMSFDG LPLGAIEAIK TTYGTGFQIL DPPRDGFSLT 101: LKLNFSKVRP DEELLTKLAS IREVVMGAPL KIIFKHLASR TVAPELDRLV AIMHRPNETF FLVPQADKVT VAFPMRFKDS VDTILATSFL KEFVEARRAA 201: ALNTAPSCSW SPTAPQELEG APKETLSANA GFVTFVIFPR HVEGKKLDRT VWNLSTFHAY VSYHVKFSEG FMHTRMRRRV ESMIQALDQA KPLEKTRSMN 301: NKSFKRLGLN EVNHTNSK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)