AT1G30380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : photosystem I subunit K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes subunit K of photosystem I reaction center. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
photosystem I subunit K (PSAK); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: photosynthesis; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, photosystem I, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Photosystem I PsaG/PsaK protein (InterPro:IPR000549), Photosystem I reaction centre, PsaK, plant (InterPro:IPR017493), Photosystem I reaction centre, PsaG/PsaK, plant (InterPro:IPR016370); Has 85 Blast hits to 85 proteins in 34 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 85; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:10722325..10723013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13207.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 130 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASTMMTTLP QFNGLRATKI SAAPVQGLAS VQPMRRKGNG ALGAKCDFIG SSTNLIMVTS TTLMLFAGRF GLAPSANRKA TAGLRLEARD SGLQTGDPAG 101: FTLADTLACG TVGHIIGVGV VLGLKNIGAI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)