AT1G30220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.988 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : inositol transporter 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Inositol transporter presenting conserved extracellular loop domains homologs of plexins/semaphorin/integrin (PSI) domains from animal type I receptors. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
inositol transporter 2 (INT2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: inositol transporter 4 (TAIR:AT4G16480.1); Has 52249 Blast hits to 41863 proteins in 2438 species: Archae - 698; Bacteria - 26108; Metazoa - 7164; Fungi - 11733; Plants - 4458; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 2086 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:10632957..10635439 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63452.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 580 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGGIIHGGA DESAFKECFS LTWKNPYVLR LAFSAGIGGL LFGYDTGVIS GALLYIRDDF KSVDRNTWLQ EMIVSMAVAG AIVGAAIGGW ANDKLGRRSA 101: ILMADFLFLL GAIIMAAAPN PSLLVVGRVF VGLGVGMASM TAPLYISEAS PAKIRGALVS TNGFLITGGQ FLSYLINLAF TDVTGTWRWM LGIAGIPALL 201: QFVLMFTLPE SPRWLYRKGR EEEAKAILRR IYSAEDVEQE IRALKDSVET EILEEGSSEK INMIKLCKAK TVRRGLIAGV GLQVFQQFVG INTVMYYSPT 301: IVQLAGFASN RTALLLSLVT AGLNAFGSII SIYFIDRIGR KKLLIISLFG VIISLGILTG VFYEAATHAP AISSLETQRF NNISCPDYKS AMNTNAWDCM 401: TCLKASSPSC GYCSSPIGKE HPGACWISDD SVKDLCHNEN RLWYTRGCPS NFGWFALLGL GLYIIFFSPG MGTVPWIVNS EIYPLRFRGI CGGIAATANW 501: ISNLIVAQSF LSLTEAIGTS WTFLIFGVIS VIALLFVMVC VPETKGMPME EIEKMLERRS MEFKFWKKKS KLVEKQNQSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)