AT1G29770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein; FUNCTIONS IN: phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; EXPRESSED IN: pollen tube; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dullard-like phosphatase domain (InterPro:IPR011948), NLI interacting factor (InterPro:IPR004274); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein (TAIR:AT1G29780.1); Has 2585 Blast hits to 2574 proteins in 264 species: Archae - 0; Bacteria - 16; Metazoa - 830; Fungi - 532; Plants - 436; Viruses - 23; Other Eukaryotes - 748 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:10424806..10425642 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31727.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 278 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MACHGFLGKP TPKSFGRHHK HARKNRNHQS RCLAAAVAAA GSIFTSLNMS IFTFHNRLLR CVSRFLRLAT TSSATPTRRP TMKQGYKKLH KREPLIRRND 101: KKRTIFLDLD ETLVHSTMEP PIRVNVDFMV RIKIEGAVIP MFVVKRPGVT EFLERISKNY RVAIFTAGLP EYASQVLDKL DKNRVISQRL YRDSCTEVNG 201: RYAKDLSLVA KNDLGSVLLV DDNPFSYSLQ PDNGVPIKPF MDDMEDQELM KLAEFFDGCY QYEDLRDAAA ELLSSKLI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)