AT1G29470.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.985 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: Golgi apparatus; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT2G34300.2); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:10310424..10313369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87208.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 770 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMGKYSRVD GKKSSGYGLT ITIVLIVSLC LVGAWMFMSS WSAPTESIDF SANERTKDVD TTKSDFKSEE VDRGSKSFPD EKNEETEVVT ETNEEKTDPE 101: KSGEENSGEK TESAEERKEF DDKNGDGDRK NGDGEKDTES ESDETKQKEK TQLEESSEEN KSEDSNGTEE NAGESEENTE KKSEENAGET EESTEKSKDV 201: FPAGDQAEIT KESSTGSGAW STQLVESQNE KKAQVSSIKW KVCNVTAGPD YIPCLDNWQA IRKLHSTKHY EHRERHCPEE SPRCLVSLPE GYKRSIKWPK 301: SREKIWYTNI PHTKLAEVKG HQNWVKMSGE YLTFPGGGTQ FKNGALHYID FLQESYPDIA WGNRTRVILD VGCGVASFGG YLFDRDVLAL SFAPKDEHEA 401: QVQFALERGI PAMSNVMGTK RLPFPGSVFD LIHCARCRVP WHIEGGKLLL ELNRALRPGG FFVWSATPVY RKTEEDVGIW KAMSKLTKAM CWELMTIKKD 501: ELNEVGAAIY QKPMSNKCYN ERSQNEPPLC KDSDDQNAAW NVPLEACIHK VTEDSSKRGA VWPESWPERV ETVPQWLDSQ EGVYGKPAQE DFTADHERWK 601: TIVSKSYLNG MGIDWSYVRN VMDMRAVYGG FAAALKDLKL WVMNVVPIDS PDTLPIIYER GLFGIYHDWC ESFSTYPRTY DLLHADHLFS SLKKRCNLVG 701: VMAEVDRILR PQGTFIVRDD METIGEIEKM VKSMKWNVRM THSKDGEGLL SVQKSWWRPT EAETIQSAIA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)