AT1G27920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : microtubule-associated protein 65-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
microtubule-associated protein 65-8 (MAP65-8); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Microtubule-associated protein, MAP65/ASE1-type (InterPro:IPR007145); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: microtubule-associated protein 65-2 (TAIR:AT4G26760.1); Has 2013 Blast hits to 1836 proteins in 335 species: Archae - 36; Bacteria - 203; Metazoa - 697; Fungi - 206; Plants - 352; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 519 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:9727106..9729848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64606.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 562 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSLQTPIEM RSSSLLDTSC GYLLRELQMI WDEVGEDKFE REKVLLDIEQ ECVEAYRRKV DHANVSRSRL HQELAESEAE LTHFLLCLGE RSVPGRPEKK 101: GGTLREQLDS IAPALREMRL RKDERVKQFR SVKGEIQKIS AEIAGRSTYE DSTRKITIDD NDLSNKKLEE YQNELHRLHD EKNERLQKVD IYICAIRDLS 201: ATLGTEASMI ITKIHPSLND LYGISKNISD DILKKLNGTV VSLEEEKHKR LEKLHHLGRA LSNLWNLMDA SYEDRQKFFH VIDLLSSAPS DVCAPGSITL 301: DIIQQAEAEV KRLDQLKASR IKELFIKKQK ELEDTCNMSH METPSTEMGN ITNLVDSGEV DHVDLLAAMD EKIARAKEEA ASRKGIIEKV DRWMLASDEE 401: RWLEEYDQDE NRYSVSRNAH RNLRRAERAR ITVSKISGLV ESILVKAKSW EVERQKVFLY NEVPLVAMLQ EYNKLRQEKE MEKQRLREMK KMSIPQPVAE 501: GDNFYMARPA SSNRRISNRS MNGGFGSGSP INRKYSGGFN NTNNNYTALG TSIRRESRKS EA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)