AT1G26870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
FEZ (FEZ); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: No apical meristem (NAM) protein (InterPro:IPR003441); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAC domain containing protein 94 (TAIR:AT5G39820.1); Has 2973 Blast hits to 2966 proteins in 76 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 2971; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:9312856..9314983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48509.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 425 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAADPSEMGD RNNDGDQKME DVLLPGFRFH PTDEELVSFY LKRKVQHNPL SIELIRQLDI YKYDPWDLPK FAMTGEKEWY FYCPRDRKYR NSSRPNRVTG 101: AGFWKATGTD RPIYSSEGNK CIGLKKSLVF YKGRAAKGVK TDWMMHEFRL PSLSEPSPPS KRFFDSPVSP NDSWAICRIF KKTNTTTLRA LSHSFVSSLP 201: PETSTDTMSN QKQSNTYHFS SDKILKPSSH FQFHHENMNT PKTSNSTTPS VPTISPFSYL DFTSYDKPTN VFNPVSCLDQ QYLTNLFLAT QETQPQFPRL 301: PSSNEIPSFL LNTSSDSTFL GEFTSHIDLS AVLAQEQCPP LVSLPQEYQE TGFEGNGIMK NMRGSNEDHL GDHCDTLRFD DFTSTINENH RHHQDLKQNM 401: TLLESYYSSL SSINSDLPAC FSSTT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)