AT1G26810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.964 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galactosyltransferase1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with β1,3-galactosyltransferase activity involved in the biosynthesis of the Lewis a epitope of certain glycoproteins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galactosyltransferase1 (GALT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Galectin, carbohydrate recognition domain (InterPro:IPR001079), Glycosyl transferase, family 31 (InterPro:IPR002659), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactosyltransferase family protein (TAIR:AT3G06440.1); Has 2303 Blast hits to 2268 proteins in 112 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 1677; Fungi - 5; Plants - 568; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 49 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:9286862..9289327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72326.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 643 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKRFYGGLLV VSMCMFLTVY RYVDLNTPVE KPYITAAASV VVTPNTTLPM EWLRITLPDF MKEARNTQEA ISGDDIAVVS GLFVEQNVSK EEREPLLTWN 101: RLESLVDNAQ SLVNGVDAIK EAGIVWESLV SAVEAKKLVD VNENQTRKGK EELCPQFLSK MNATEADGSS LKLQIPCGLT QGSSITVIGI PDGLVGSFRI 201: DLTGQPLPGE PDPPIIVHYN VRLLGDKSTE DPVIVQNSWT ASQDWGAEER CPKFDPDMNK KVDDLDECNK MVGGEINRTS STSLQSNTSR GVPVAREASK 301: HEKYFPFKQG FLSVATLRVG TEGMQMTVDG KHITSFAFRD TLEPWLVSEI RITGDFRLIS ILASGLPTSE ESEHVVDLEA LKSPTLSPLR PLDLVIGVFS 401: TANNFKRRMA VRRTWMQYDD VRSGRVAVRF FVGLHKSPLV NLELWNEART YGDVQLMPFV DYYSLISWKT LAICIFGTEV DSAKFIMKTD DDAFVRVDEV 501: LLSLSMTNNT RGLIYGLINS DSQPIRNPDS KWYISYEEWP EEKYPPWAHG PGYIVSRDIA ESVGKLFKEG NLKMFKLEDV AMGIWIAELT KHGLEPHYEN 601: DGRIISDGCK DGYVVAHYQS PAEMTCLWRK YQETKRSLCC REW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)