AT1G25380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD+ transporter 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a mitochondrial-localized NAD+ transporter that transports NAD+ in a counter exchange mode with ADP and AMP in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAD+ transporter 2 (NDT2); FUNCTIONS IN: binding, NAD transporter activity; INVOLVED IN: transport, NAD transport, mitochondrial transport; LOCATED IN: mitochondrial inner membrane, membrane; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108), Adenine nucleotide translocator 1 (InterPro:IPR002113); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD+ transporter 1 (TAIR:AT2G47490.1); Has 30606 Blast hits to 14728 proteins in 470 species: Archae - 0; Bacteria - 8; Metazoa - 12581; Fungi - 9084; Plants - 5612; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 3316 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8903726..8905818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39498.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 363 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIEHGNSTFD YRSIREVAAN AGAGATAGAI AATFVCPLDV IKTRLQVLGL PEAPASGQRG GVIITSLKNI IKEEGYRGMY RGLSPTIIAL LPNWAVYFSV 101: YGKLKDVLQS SDGKLSIGSN MIAAAGAGAA TSIATNPLWV VKTRLMTQGI RPGVVPYKSV MSAFSRICHE EGVRGLYSGI LPSLAGVSHV AIQFPAYEKI 201: KQYMAKMDNT SVENLSPGNV AIASSIAKVI ASILTYPHEV IRAKLQEQGQ IRNAETKYSG VIDCITKVFR SEGIPGLYRG CATNLLRTTP SAVITFTTYE 301: MMLRFFRQVV PPETNRSDDR RREEERKNLV SRRGEEEDKD LGLRESQTQS NKISTPHIPL GSK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)