AT1G25220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : anthranilate synthase beta subunit 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Catalyzes the first step of tryptophan biosynthesis: Chorismate L-Glutamine = Anthranilate Pyruvate L-Glutamate. Functions as a heterocomplex with anthranilate synthase alpha subunit (ASA1 or ASA2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
anthranilate synthase beta subunit 1 (ASB1); FUNCTIONS IN: anthranilate synthase activity; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: pericycle, cotyledon vascular system, primary root tip, root, lateral root primordium; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamine amidotransferase class-I, C-terminal (InterPro:IPR000991), Glutamine amidotransferase superfamily (InterPro:IPR011702), Anthranilate synthase, glutamine amidotransferase domain (InterPro:IPR006221), Carbamoyl phosphate synthase, GATase domain (InterPro:IPR001317), Glutamine amidotransferase type 1 (InterPro:IPR017926), Anthranilate synthase component II/delta crystallin (InterPro:IPR006220); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glutamine amidotransferase type 1 family protein (TAIR:AT5G57890.1); Has 24239 Blast hits to 24239 proteins in 3351 species: Archae - 587; Bacteria - 15803; Metazoa - 583; Fungi - 677; Plants - 202; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6387 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:8837430..8839478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30461.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 276 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAASTLYKSC LLQPKSGSTT RRLNPSLVNP LTNPTRVSVL GKSRRDVFAK ASIEMAESNS IPSVVVNSSK QHGPIIVIDN YDSFTYNLCQ YMGELGCHFE 101: VYRNDELTVE ELKKKNPRGV LISPGPGTPQ DSGISLQTVL ELGPLVPLFG VCMGLQCIGE AFGGKIVRSP FGVMHGKSSM VHYDEKGEEG LFSGLSNPFI 201: VGRYHSLVIE KDTFPSDELE VTAWTEDGLV MAARHRKYKH IQGVQFHPES IITTEGKTIV RNFIKIVEKK ESEKLT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)