AT1G25155.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.957 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glutamine amidotransferase type 1 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Glutamine amidotransferase type 1 family protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity, anthranilate synthase activity; INVOLVED IN: glutamine metabolic process, biosynthetic process, metabolic process; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamine amidotransferase class-I, C-terminal (InterPro:IPR000991), Glutamine amidotransferase superfamily (InterPro:IPR011702), Anthranilate synthase, glutamine amidotransferase domain (InterPro:IPR006221), Carbamoyl phosphate synthase, GATase domain (InterPro:IPR001317), Glutamine amidotransferase type 1 (InterPro:IPR017926), Anthranilate synthase component II/delta crystallin (InterPro:IPR006220); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glutamine amidotransferase type 1 family protein (TAIR:AT1G24909.1); Has 23967 Blast hits to 23967 proteins in 3339 species: Archae - 582; Bacteria - 15663; Metazoa - 561; Fungi - 667; Plants - 197; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6297 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:8823052..8824821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24693.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 222 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAESNSIPSV VINSSKQNGP IIVIDNYDSF TYNLCQYMGE LQCHFEVYRN DELTVEELKR KNPRGVLISP GPGTPQDSGI SLQTVLELGP LVPLFGVCMG 101: LQCIGEAFGG KIVRSPFGVM HGKSSMVHYD EKGEEGLFSG LSNPFIVGRY HSLVIEKDTF PSDELEVTAW TEDGLVMAAR HRKYKHIQGV QFHPESIITT 201: EGKTIVRNFI KIVEKKDSEK LT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)