AT1G22710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sucrose-proton symporter 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes for a high-affinity transporter essential for phloem loading and long-distance transport. A major sucrose transporter, AtSUC2 can also transport a wide range of physiological and synthetic glucose conjugates with both α- or β-linkage. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sucrose-proton symporter 2 (SUC2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sucrose/H+ symporter, plant (InterPro:IPR005989), Major facilitator superfamily MFS-1 (InterPro:IPR011701), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sucrose-proton symporter 1 (TAIR:AT1G71880.1); Has 2329 Blast hits to 2203 proteins in 568 species: Archae - 32; Bacteria - 908; Metazoa - 423; Fungi - 192; Plants - 420; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 354 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:8030911..8032970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54550.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSHPMEKAA NGASALETQT GELDQPERLR KIISVSSIAA GVQFGWALQL SLLTPYVQLL GIPHKWASLI WLCGPISGML VQPIVGYHSD RCTSRFGRRR 101: PFIVAGAGLV TVAVFLIGYA ADIGHSMGDQ LDKPPKTRAI AIFALGFWIL DVANNTLQGP CRAFLADLSA GNAKKTRTAN AFFSFFMAVG NVLGYAAGSY 201: RNLYKVVPFT MTESCDLYCA NLKTCFFLSI TLLLIVTFVS LCYVKEKPWT PEPTADGKAS NVPFFGEIFG AFKELKRPMW MLLIVTALNW IAWFPFLLFD 301: TDWMGREVYG GNSDATATAA SKKLYNDGVR AGALGLMLNA IVLGFMSLGV EWIGRKLGGA KRLWGIVNFI LAICLAMTVV VTKQAENHRR DHGGAKTGPP 401: GNVTAGALTL FAILGIPQAI TFSIPFALAS IFSTNSGAGQ GLSLGVLNLA IVVPQMVISV GGGPFDELFG GGNIPAFVLG AIAAAVSGVL ALTVLPSPPP 501: DAPAFKATMG FH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)