AT1G22340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 85A7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 85A7 (UGT85A7); FUNCTIONS IN: UDP-glycosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups, glucuronosyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 8 plant structures; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucosyl transferase 85A2 (TAIR:AT1G22360.1); Has 7763 Blast hits to 7662 proteins in 424 species: Archae - 0; Bacteria - 289; Metazoa - 2112; Fungi - 32; Plants - 5212; Viruses - 58; Other Eukaryotes - 60 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:7890464..7892090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55459.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 487 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESHVVHNAQ KPHVVCVPYP AQGHINPMLK VAKLLYAKGF HVTFVNTLYN HNRLLRSRGP NALDGFPSFR FESIPDGLPE TDGDRTQHTP TVCMSIEKNC 101: LAPFKEILRR INDKDDVPPV SCIVSDGVMS FTLDAAEELG VPEVIFWTNS ACGFMTILHF YLFIEKGLSP FKDESYMSKE HLDTVIDWIP SMKNLRLKDI 201: PSYIRTTNPD NIMLNFLIRE VERSKRASAI ILNTFDELEH DVIQSMQSIL PPVYSIGPLH LLVKEEINEA SEIGQMGLNL WREEMECLDW LDTKTPNSVL 301: FVNFGCITVM SAKQLEEFAW GLAASRKEFL WVIRPNLVVG EAMVVLPQEF LAETIDRRML ASWCPQEKVL SHPAIGGFLT HCGWNSTLES LAGGVPMICW 401: PCFSEQPTNC KFCCDEWGVG IEIGKDVKRE EVETVVRELM DGEKGKKLRE KAEEWRRLAE EATRYKHGSS VMNLETLIHK VFLENLR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)