AT1G22290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.649 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 14-3-3 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
14-3-3 family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 14-3-3 protein (InterPro:IPR000308); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: general regulatory factor 10 (TAIR:AT1G22300.2); Has 2461 Blast hits to 2459 proteins in 362 species: Archae - 2; Bacteria - 2; Metazoa - 1174; Fungi - 281; Plants - 702; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 300 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:7876966..7877915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22408.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 196 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENEQSTHVH FASLSSSSER YNETFEEIKK AMKKSVQLKA ELSAKERNLV SVGYKNVISA RRASLEILSS IVQKEESKGN EENVKKLKNY RNKVEDELAK 101: ICNDILSVIN KQLIPSSTTV DSSVLFYNML ADFSSNAESK EATDQSLDAY KRLVWYQQFQ LYMTLNWTSV FLNSPESAYQ LAKQAFDDAI NEFDSK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)