AT1G22210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.679 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity, trehalose-phosphatase activity; INVOLVED IN: trehalose biosynthetic process, metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB (InterPro:IPR006379), Trehalose-phosphatase (InterPro:IPR003337); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: trehalose-6-phosphate phosphatase (TAIR:AT1G78090.1); Has 2333 Blast hits to 2328 proteins in 832 species: Archae - 41; Bacteria - 1319; Metazoa - 218; Fungi - 151; Plants - 473; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 131 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7841518..7843812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36365.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 320 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKITDISGKI ETLVDSLRDM SPTRVRSSFS DEHVSENDDE RSSWIALHPS ALDMFEQIMR DAEGKQIIMF LDYDGTLSLI TEDHDRAYIT DEMREVVKEV 101: ATYFKTAIIS GRSTDKVQSF VKLTGIHYAG SHGMDIKGPT NTDQSNQEEV MFQPASDYLP MIDEVVNVLK EKTKSIPGAT VEHNKFCLTV HFRRVDETGW 201: AALAEQVRLV LIDYPKLRLT QGRKVLELRP SIKWDKGKAL EFLLNSLGIA ESKDVLPVYI GDDRTDEDAF KVLCERGQGF GIIVSKTIKE TYASYSLQDP 301: SQVKEFLERL VKWKKQTLGE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)