AT1G22150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfate transporter 1;3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
sulfate transporter Sultr1;3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfate transporter 1;3 (SULTR1;3); FUNCTIONS IN: sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: sulfate transport, transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, sperm cell, flower, pollen tube; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfate transporter 1;2 (TAIR:AT1G78000.2); Has 9966 Blast hits to 9871 proteins in 1873 species: Archae - 35; Bacteria - 6045; Metazoa - 1156; Fungi - 451; Plants - 559; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1720 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7818361..7821344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72230.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 656 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSARAHPVDD DGEISPVERS SPRQANTPYV HKVEVPPKQN LFNEFMYTFK ETFFHDDPLR HFKDQSKSKK LMLGIQSVFP VIEWGRKYNL KLFRGDLIAG 101: LTIASLCIPQ DIGYAKLASL DPKYGLYSSF VPPLVYACMG SSKDIAIGPV AVVSLLLGTL LRAEIDPNTN PNEYLRLAFT STFFAGVTQA ALGFFRLGFL 201: IDFLSHAAVV GFMGGAAITI ALQQLKGFLG INKFTKKTDI IAVLSSVISS AHHGWNWQTI LISASFLIFL LISKFIGKRN KKLFWIPAIA PLVSVIISTF 301: FVYITRADKK GVQIVKHLDK GLNPSSLRLI YFSGDYLLKG FRIGVVSGMV ALTEAVAIGR TFAAMKDYQI DGNKEMVALG AMNVIGSMTS CYVSTGSFSR 401: SAVNFMAGCQ TAVSNIIMSI VVLLTLLFLT PLFKYTPNAI LAAIIINAVI PLVDVNATIL IFKIDKLDFV ACMGAFFGVI FVSVEIGLLI AVGISFAKIL 501: LQVTRPRTAI LGKIPGTSVY RNINQYPEAT RIPGVLTIRV DSAIYFSNSN YVRERIQRWL TDEEEMVEAA RLPRIQFLII EMSPVTDIDT SGIHALEDLY 601: KSLQKRDIQL VLANPGPPVI NKLHVSHFAD LIGHDKIFLT VAEAVDSCSP KLSDEV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)