AT1G22015.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.858 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Galactosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DD46; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, galactosyltransferase activity; INVOLVED IN: protein amino acid glycosylation; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 31 (InterPro:IPR002659); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactosyltransferase family protein (TAIR:AT1G77810.2); Has 1691 Blast hits to 1677 proteins in 112 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 1078; Fungi - 8; Plants - 564; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 39 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:7751225..7753425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45202.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 398 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKHNNKVSKR LTMTWVPLLC ISCFFLGAIF TSKLRSASSD SGSQLILQHR RDQELKIVTQ DYAHEKKKSQ DNDVMEEVLK THKAIESLDK SVSMLQKQLS 101: ATHSPQQIVN VSATNSSTEG NQKNKVFMVI GINTAFSSRK RRDSLRETWM PQGEKLEKLE KEKGIVVKFM IGHSSTPNSM LDKEIDSEDA QYNDFFRLDH 201: VEGYYNLSAK TKSFFSSAVA KWDAEFYVKI DDDVHVNLGT LASTLASHRS KPRVYIGCMK SGPVLTKKTA KYREPEFWKF GEEGNKYFRH ATGQIYAISK 301: DLATYISNNQ PILHKYANED VTLGSWFIGL EVEQIDDRNF CCGTPPDCEM RAEAGEMCVA TFDWKCSGVC RSVDRMWMVH VMCGEGSKAV WDANLKLS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)