AT1G21430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.984 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Flavin-binding monooxygenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
YUC11; FUNCTIONS IN: NADP or NADPH binding, oxidoreductase activity, monooxygenase activity, FAD binding, flavin-containing monooxygenase activity; INVOLVED IN: regulation of anatomical structure morphogenesis; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II (InterPro:IPR000103), FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Flavin-containing monooxygenase-like (InterPro:IPR020946); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Flavin-containing monooxygenase family protein (TAIR:AT1G48910.1); Has 9762 Blast hits to 9749 proteins in 1331 species: Archae - 35; Bacteria - 5524; Metazoa - 772; Fungi - 1287; Plants - 602; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1542 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7500845..7502186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43360.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKEIKILVL IIGAGPAGLA TSACLNRLNI PNIVVERDVC SASLWKRRSY DRLKLHLAKQ FCQLPHMPFP SNTPTFVSKL GFINYLDEYA TRFNVNPRYN 101: RNVKSAYFKD GQWIVKVVNK TTALIEVYSA KFMVAATGEN GEGVIPEIPG LVESFQGKYL HSSEYKNGEK FAGKDVLVVG CGNSGMEIAY DLSKCNANVS 201: IVVRSQVHVL TRCIVRIGMS LLRFFPVKLV DRLCLLLAEL RFRNTSRYGL VRPNNGPFLN KLITGRSATI DVGCVGEIKS GKIQVVTSIK RIEGKTVEFI 301: DGNTKNVDSI VFATGYKSSV SKWLEVDDGD LFNENGMPKR EFPDHWKGKN GLYSAGFGKQ GLAGISRDAR NIARDIDSLV CGRSSKNKLS K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)