AT1G21065.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Uncharacterised protein family UPF0047 (InterPro:IPR001602); Has 3800 Blast hits to 3784 proteins in 1137 species: Archae - 215; Bacteria - 2154; Metazoa - 42; Fungi - 99; Plants - 99; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1191 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7374210..7375644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23709.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 217 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVMMVKVKGL IGRFWFGVGG GIVLAIVVVI IGLRGTQKAM SSTFLFSGVV PLRVRSVLTP ANPATDRASM ASSSGAKWAQ KTITLPPLRR GCHLITPKIL 101: KEIREDLSDF NCGLAHVFLQ HTSASLTINE NYDPDVQADT ETFLNRIVPE GNSAPWRHTM EGPDDMPAHI KSSMFGCQLT IPITKGKLSM GTWQGIWLCE 201: HRDAPTARRV VVTLNGI |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)