AT1G20620.4
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : catalase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Catalase, catalyzes the breakdown of hydrogen peroxide (H2O2) into water and oxygen. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
catalase 3 (CAT3); FUNCTIONS IN: catalase activity, cobalt ion binding; INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: in 9 components; EXPRESSED IN: 29 plant structures; EXPRESSED DURING: 17 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Catalase-like domain, haem-dependent (InterPro:IPR020835), Catalase related subgroup (InterPro:IPR018028), Catalase (InterPro:IPR002226), Catalase, N-terminal (InterPro:IPR011614), Catalase-related immune responsive (InterPro:IPR010582); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: catalase 1 (TAIR:AT1G20630.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7144692..7146193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43951.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 377 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRDIRGFAVK FYTREGNFDL VGNNTPVFFI RDGIQFPDVV HALKPNPKTN IQEYWRILDY MSHLPESLLT WCWMFDDVGI PQDYRHMEGF GVHTYTLIAK 101: SGKVLFVKFH WKPTCGIKNL TDEEAKVVGG ANHSHATKDL HDAIASGNYP EWKLFIQTMD PADEDKFDFD PLDVTKIWPE DILPLQPVGR LVLNRTIDNF 201: FNETEQLAFN PGLVVPGIYY SDDKLLQCRI FAYGDTQRHR LGPNYLQLPV NAPKCAHHNN HHEGFMNFMH RDEEINYYPS KFDPVRCAEK VPTPTNSYTG 301: IRTKCVIKKE NNFKQAGDRY RSWAPDRQDR FVKRWVEILS EPRLTHEIRG IWISYWSQAD RSLGQKLASR LNVRPSI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)