AT1G20590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.629 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
7-day old Arabidopsis seedling (no marker)
7-day old Arabidopsis seedling (nuclear marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cyclin family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cyclin family protein; FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase regulator activity; INVOLVED IN: regulation of cell cycle; LOCATED IN: endomembrane system, nucleus; EXPRESSED IN: male gametophyte, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin, A/B/D/E (InterPro:IPR014400), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cyclin B2;3 (TAIR:AT1G20610.1); Has 3281 Blast hits to 3278 proteins in 328 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1609; Fungi - 468; Plants - 793; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 411 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:7131166..7132183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22663.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 199 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSFLAVHQIV RKKLQLVGVT ALLLACKYEE VSVPVVDDLI LISDKAYSRR EVLDMEKLMA NTLQFNFSLP TPYVFMKRFL KAAQSDKKLE ILSFFMIELC 101: LVEYEMLEYL PSKLAASAIY TAQCTLKGFE EWSKTCEFHT GYNEEQLLAC ARKMVAFHHK AGTGKLTGST THLSSFMLQE VNQLGFCFKG GKNYNKNLI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)