AT1G20160.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.571 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Subtilisin-like serine endopeptidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATSBT5.2; FUNCTIONS IN: identical protein binding, serine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, negative regulation of catalytic activity; LOCATED IN: apoplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease-associated PA (InterPro:IPR003137), Peptidase S8/S53, subtilisin/kexin/sedolisin (InterPro:IPR000209), Peptidase S8, subtilisin-related (InterPro:IPR015500), Proteinase inhibitor I9, subtilisin propeptide (InterPro:IPR010259), Peptidase S8/S53, subtilisin, active site (InterPro:IPR022398); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Subtilisin-like serine endopeptidase family protein (TAIR:AT1G20150.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6990852..6993737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 77042.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 730 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSASSAANA NRAQILINTM FKRRANDLLH TYKHGFSGFA ARLTAEEAKV IAKKPGVVSV FPDPHFQLHT THSWDFLKYQ TSVKVDSGPP SSASDGSYDS 101: IVGILDTGIW PESESFNDKD MGPIPSRWKG TCMEAKDFKS SNCNRKIIGA RYYKNPDDDS EYYTTRDVIG HGSHVSSTIA GSAVENASYY GVASGTAKGG 201: SQNARIAMYK VCNPGGCTGS SILAAFDDAI ADGVDVLSLS LGAPAYARID LNTDPIAIGA FHAVEQGILV ICSAGNDGPD GGTVTNTAPW IMTVAANTID 301: RDFESDVVLG GNKVIKGEGI HFSNVSKSPV YPLIHGKSAK SADASEGSAR ACDSDSLDQE KVKGKIVLCE NVGGSYYASS ARDEVKSKGG TGCVFVDDRT 401: RAVASAYGSF PTTVIDSKEA AEIFSYLNST KDPVATILPT ATVEKFTPAP AVAYFSSRGP SSLTRSILKP DITAPGVSIL AAWTGNDSSI SLEGKPASQY 501: NVISGTSMAA PHVSAVASLI KSQHPTWGPS AIRSAIMTTA TQTNNDKGLI TTETGATATP YDSGAGELSS TASMQPGLVY ETTETDYLNF LCYYGYNVTT 601: IKAMSKAFPE NFTCPADSNL DLISTINYPS IGISGFKGNG SKTVTRTVTN VGEDGEAVYT VSVETPPGFN IQVTPEKLQF TKDGEKLTYQ VIVSATASLK 701: QDVFGALTWS NAKYKVRSPI VISSESSRTN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)